西醫以科學為基礎，靠各種儀器檢驗分析診斷疾病，再加以治療或控制病情。而中醫的基礎是什麼？從<<黃帝內經>>所記載的內容分析，醫理等同於自然法則，例如「天有陰陽，人有十二節。天有寒暑，人有虛實。」、「天有五行御五位，人有五臟化五氣」、「天地之間，六合之內，其氣九州、九竅、五臟十二節，皆通乎天氣。」，而自然法則總以言之就是天地陰陽變化的道理。
陰陽應象大論篇云：「陰陽者天地之道也，萬物之綱紀也，變化之父母，生殺之本始。」所以中醫的一切醫理全都建構在陰陽之道上，身為一個中醫師，對陰陽理論了解得越透徹，醫術才能發揮得越精深，在陰陽的變化中只要有一個環節出現錯誤，論病診斷上就會一步錯步步錯了。
要說現代中醫所犯的最大過失是陰陽不分，此話聽起來可笑，其中最明顯就是不分男女，雖然在某些特有的疾病上(婦女病或男人隱疾)有用藥的分別，其餘不論是把脈或針灸經穴，都是同病同治，自古以來，大概只有方老師研究的「十二經陰陽氣脈病理療法」，清楚的以陰陽理論，將經穴治療法細分成男女、上下、左右、虛實各有不同的治法，連他獨創的六部十八候把脈技法都有男女的分別。
內經中關於陰陽的論述非常詳盡，天為陽，地為陰；有形為陰，無形為陽；男體為陽，女體為陰；陽氣由左而右順行，陰氣由右而左逆行，既然如此，診斷治療若不分男女，在醫理上不就自相矛盾了嗎？
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